Research groups

Grupo: Genomics in Plant Breeding

El grupo de Marcadores Moleculares del IBMCP se fundó en otoño de 2008, tras varias estancias en diversos centros de investigación como el IVIA; la Universidad de Cornell y el IRTA (actualmente integrado en el CRAG).

El principal objetivo es la aplicación de la genómica para la disección de genes o de QTLs implicados en caracteres de calidad de fruto en especies de interés agronómico, fundamentalmente hortícolas.   Nuestro cuerpo teórico se entronca en la genética de poblaciones, genética cuantitativa, evolución y teoría de la mejora que integramos con la agronomía, biología molecular y genómica. Pretendemos generar conocimiento y herramientas que sean útiles para el desarrollo de nuevos cultivares que respondan a las necesidades actuales del sector, así como, conocimiento básico para comprender mejor las bases genéticas y, en última instancia, moleculares, de la variación fenotípica de los caracteres de fruto.

Utilizamos marcadores moleculares, genotipado de alto rendimiento,  mapas genéticos, análisis de QTLs y desarrollo de líneas de introgresión o QTL-NILs, con un énfasis especial en el descubrimiento de nueva variabilidad genética a partir de especies silvestres o germoplasma no adaptado.

INTERÉS

Las variedades actuales son producto del proceso de selección realizado por los agricultores durante muchos siglos. Una de las consecuencias es que la variabilidad genética dentro de las especies cultivadas se ha reducido notablemente. Sin embargo todavía existe un gran potencial en la variabilidad genética que se encuentra en las especies silvestres relacionadas. 

Nuestro principal interés es descubrir variabilidad genética "oculta" en especies silvestres que pueda incorporarse en las variedades actuales para proporcionarles nuevas características que demandan tanto la industria como los consumidores: mayor productividad, resistencia a enfermedades y estreses abióticos, calidad nutricional, comportamiento poscosecha.

Por un lado hay un enfoque práctico, pero también queremos aprovechar para estudiar las bases genéticas de estos caracteres combinando la genética cuantitativa y la genómica.

LINEAS DE INVESTIGACIÓN

Las líneas actuales de investigación son:

  1. Estudio del desequilibrio de ligamiento en colecciones de germoplasma de melón. El desequilibrio de ligamiento es una medida de la evolución estructural de los genomas y es un conocimiento previo necesario para implementar estrategias de genética de asociación.
  2. Caracterización de QTLs implicados en la morfología del fruto y en la domesticación de melón. Las variedades de melón presentan una alta variabilidad en forma y tamaño de sus frutos. Hemos localizado varios QTLs implicados en la forma y tamaño del fruto y estamos caracterizándoles para comprender mejor las bases genéticas de éste carácter. Paralelamente, el melón se ha desarrollado a partir de ancestros silvestres que producen frutos muy pequeños sin pulpa comestible. Estamos identificando  los genes responsables de la transformación del melón silvestre en las variedades actuales.
  3. Generación de líneas de introgresión en tomate a partir de Solanum. pimpinellifolium. Para facilitar el aprovechamiento de la variabilidad genética incluida en S. pimpinellifolium, estamos desarrollando una genoteca de líneas de introgresión a partir de esta especie silvestre.
Genómica en Mejora Vegetal

Staff Researchers

Other Group Members

Temporary Visitors

Cristina Esteras. Estera Gómez, Profesora Ayudante Doctor. UPV. Equipo investigación proyectos cucurbitáceas María Ferriol Molina, Profesora Titular Universidad. UPV. Equipo investigación proyectos cucurbitáceas. Pablo Sipowicz. Tesis Fin de Máster Gonçalo da Silva. Tesis Fin de Máster
  • Tzitzikas EN, Monforte AJ, Fatihi A, Kypriotakis Z, Iacovides TA, Ioannides IM, Kalaitzis P (2009)
    Genetic Diversity and Population Structure of Traditional Greek and Cypriot Melon Cultigens (Cucumis melo L.) Based on Simple Sequence Repeat Variability
    Hortscience 44, 1820-1824.
  • Gisbert AD, Romero C, Martínez-Calvo J, Leida C, Llácer G, Badenes ML (2009)
    Genetic diversity evaluation of a loquat (Eriobotrya japonica (Thunb) Lindl) germplasm collection by SSRs and S-allele fragments
    Euphytica 168: 121-134
  • Obando-Ulloa JM, Eduardo I, Monforte AJ, Fernandez-Trujillo JP (2009)
    Identification of QTLs related to sugar and organic acid composition in melon using near-isogenic lines
    Scientia Horticulturae 121, 425-433
  • • Fernandez-Silva I, Moreno E, Eduardo I, Arus P, Alvarez JM, Monforte AJ (2009)
    On the Genetic Control of Heterosis for Fruit Shape in Melon (Cucumis Melo L.).
    Journal of Heredity 100, 229-235
  • Tijskens LMM, Dos-Santos N, Jowkar MM, Obando-Ulloa JM, Moreno E, Schouten RE, Monforte AJ, Fernandez-Trujillo JP (2009)
    Postharvest firmness behaviour of near-isogenic lines of melon
    Postharvest Biology and Technology 51, 320-326
  • Gisbert AD, Badenes ML, Tobutt KR, Llácer G and Romero C (2008)
    Determination of the S-allele composition of sweet cherry (Prunus avium L.) cultivars grown in the southeast of Spain by PCR analysis
    Journal of Horticultural Science & Biotechnology 83(2): 246-252
  • Soriano JM, Vera-Ruiz EM, Vilanova S, Martínez-Calvo J, Llácer G, Badenes ML, Romero C (2008)
    Identification and mapping of a locus conferring Plum Pox Virus resistance in two apricot improved linkage maps
    Tree Genetics & Genomes 4:391-402
  • Martínez-Calvo J, Gisbert AD, Alamar MC, Hernandorena R, Romero C, Llácer G and Badenes ML (2008)
    Study of a germplasm collection of loquat (Eriobotrya japonica Lindl) by multivariate analysis
    Genetic Resources and Crop Evolution 55: 695-703
  • Vilanova S, Badenes ML, Burgos L, Martínez-Calvo J, Llácer G, Romero C (2006)
    Self-compatibility of two apricot selections is associated with two pollen-part mutations of different nature
    Plant Physiology 142: 629-641
  • Eduardo I, Arus P, Monforte AJ (2005)
    Development of a genomic library of near isogenic lines (NILs) in melon (Cucumis melo L.) from the exotic accession PI161375

    Theoretical and Applied Genetics 112: 139-148

Entidad financiadora: 
EUROPEAN COMMISSION Horizon 2020 - Research and Innovation Framework Programme
IP: 
Antonio Granell
Entidad financiadora: 
MINECO
IP: 
Antonio J. Monforte
Entidad financiadora: 
EU (Plant-KBBE)
IP: 
Daniele Hosemans (Coordinador Internacional) . Antonio J Monforte (CSIC).
Entidad financiadora: 
Programa bilteral CSIC.
IP: 
Antonio J Monforte
Entidad financiadora: 
MCINN.
IP: 
Antonio J. Monforte
Entidad financiadora: 
FECYT
IP: 
Antonio J. Monforte y Antonio Granell
Entidad financiadora: 
MCINN
IP: 
Antonio Granell
Entidad financiadora: 
Semillas Arnerdo SA.
IP: 
Fernando Nuez
Entidad financiadora: 
Genoma España
IP: 
Pere Puigdomenech
Desarrollo de variedades de melón por intercruzamientos y aplicación de marcadores moleculares 01/01/2013-01/07/2016
Entidad financiadora: 
Inveseed S.L.U.
IP: 
Antonio Monforte
Caracterización molecular de proteínas floemáticas asociadas al transporte sistémico de RNAs endógenos y patogénicos en miembros de la familia Cucurbitaceae 01/01/2012 to:31/12/ 2012
Entidad financiadora: 
UPV
IP: 
Maria José Díez
EL TRANSPORTE POR EL FLOEMA, UNA NUEVA HERRAMIENTA PARA MEJORA
Entidad financiadora: 
Universidad Politécnica de Valencia
IP: 
Belén Picó
A holistic multi-actor approach towards the design of new tomato varieties and management practices to improve yield and quality in the face of climate change. TomGEM 01/04/2016 to: 31/03/2019
Entidad financiadora: 
European Commission. SFS-05-2015: Strategies for crop productivity, stability and quality
IP: 
Monder Bouzayen
Evolución y diversificación en Cucumis. Genetica de la domesticacion, morfologia de fruto y barreras reproductivas 01/01/2016 to: 31/12/2018
Entidad financiadora: 
MINECO
IP: 
Antonio J. Monforte Gilabert. y Carlos Romero Salvador