Grupos de investigación

Grupo: Genómica en Mejora Vegetal

Genómica en Mejora Vegetal

Origen y Antecedentes

El grupo de Genómica en Mejora Vegetal se fundó en 2008 con la incorporación de Antonio J. Monforte al IBMCP como Científico Titular CSIC, quien realizó previamente sus Tesis Doctoral en el IVIA, posteriormente una estancia postdoctoral en la Universidad de Cornell y fue investigador durante más de 8 años en el IRTA (ahora fusionado con el CRAG). Se inicia entonces una línea de trabajo sobre la aplicación de herramientas genómicas en mejora genética que no existía previamente en el IBMCP. Las primeras personas en trabajar en el grupo fueron los doctorandos Gerardo Sánchez y Walter Barrantes, la investigadora postdoctoral Aurora Díaz y la técnico de laboratorio Soledad Casal que asientan la línea de investigación. En 2014 se incorpora Carlos Romero como Científico Titular CSIC. Carlos había realizado su Tesis Doctoral en el IBMCP, integrándose posteriormente en el Dpto. de investigación de la empresa de semillas Rijk Zwaan S. A. y más tarde en el IVIA donde fue investigador durante más de 12 años. El grupo se encuentra actualmente consolidado con las incorporaciones de las investigadoras posdoctorales Clara Pons y Maria José Gonzalo.

Líneas de Investigación

El principal objetivo es la aplicación de la genómica para la identificación implicados en caracteres de interés agronómico, fundamentalmente hortícolas. Nuestro cuerpo teórico se entronca en la genética de poblaciones, genética cuantitativa, evolución y teoría de la mejora que integramos con la agronomía, biología molecular y genómica. Generamos conocimiento y herramientas útiles para el desarrollo de nuevos cultivares que respondan a las necesidades actuales del sector, así como básico para comprender mejor las bases genéticas y moleculares, de la variación fenotípica. Tenemos un especial interés es descubrir variabilidad genética "oculta" en especies silvestres para mejorar productividad, resistencia a enfermedades y estreses abióticos, calidad nutricional, comportamiento poscosecha.

Las herramientas básicas que utilizamos son los marcadores moleculares, empezamos con RFLPs, seguimos con SSRs, SNPs y actualmente genotipado de alto rendimiento y secuenciación masiva. Nuestras estrategias incluyen el desarrollo de mapas genéticos, análisis de QTLs y desarrollo de líneas de introgresión o QTL-NILs.

Concretamente las líneas de investigación en la que estamos trabajando son:

- Bases genéticas de la morfología del fruto en melón

- Control genético de la domesticación en melón

- Barreras reproductivas interespecíficas en el género Cucumis

- Sistema de autoincompatibilidad gametofítica en Prunus

- Caracterización y valorización de las variedades de tomate tradicionales europeas (TRADITOM)

- Tolerancia a altas temperaturas en tomate (TOMGEN)

Bibliografía destacada

DIAZ, A., FERGANY, M., FORMISANO, G., ZIARSOLO, P., BLANCA, J., FEI, Z.J., STAUB, J.E., ZALAPA, J.E., CUEVAS, H.E., DACE, G., OLIVER, M., BOISSOT, N., DOGIMONT, C., PITRAT, M., HOFSTEDE, R., VAN KOERT, P., HAREL-BEJA, R., TZURI, G., PORTNOY, V., COHEN, S., SCHAFFER, A., KATZIR, N., XU, Y., ZHANG, H.Y., FUKINO, N., MATSUMOTO, S., GARCIA-MAS, J., & MONFORTE, A.J. (2011). A consensus linkage map for molecular markers and Quantitative Trait Loci associated with economically important traits in melon (Cucumis melo L.). BMC Plant Biology 11.

MONFORTE, A.J., DIAZ, A., CANO-DELGADO, A., & VAN DER KNAAP, E. (2014) The genetic basis of fruit morphology in horticultural crops: lessons from tomato and melon. Journal of Experimental Botany 65:4625-4637.

TIEMAN, D., ZHU, G.T., RESENDE, M.F.R., LIN, T., TAYLOR, M., ZHANG, B., IKEDA, H., LIU, Z.Y., FISHER, J., ZEMACH, I., MONFORTE, A., ZAMIR, D., GRANELL, A., KIRST, M., HUANG, S., KLEE, H., NGUYEN, C., BIES, D., RAMBLA, J.L., & BELTRAN, K.S.O. (2017) A chemical genetic roadmap to improved tomato flavor. Science 355:391-394.

ZURIAGA E, MOLINA L, BADENES ML & ROMERO C (2012) Physical mapping of a pollen modifier locus controlling self-incompatibility in apricot and synteny analysis within the Rosaceae. Plant Molecular Biology 79:229–242.

ZURIAGA E, MUÑOZ-SANZ JV, MOLINA L, GISBERT AD, BADENES ML & ROMERO C (2013) An S-locus independent pollen factor confers self-compatibility in “Katy” apricot. PLoS One 8:e53947.

MUÑOZ-SANZ JV, ZURIAGA E, LÓPEZ I, BADENES ML & ROMERO C (2017) Self-(in)compatibility in apricot germplasm is controlled by two major loci, S and M. BMC Plant Biology 17: 82.

Genómica en Mejora Vegetal

Investigadores

Personal Contratado y Becarios

Visitantes

Cristina Esteras. Estera Gómez, Profesora Ayudante Doctor. UPV. Equipo investigación proyectos cucurbitáceas María Ferriol Molina, Profesora Titular Universidad. UPV. Equipo investigación proyectos cucurbitáceas. Pablo Sipowicz. Tesis Fin de Máster Gonçalo da Silva. Tesis Fin de Máster
  • Deleu W, Esteras C, Roig C, Gonzalez-To M, Fernandez-Silva I, Gonzalez-Ibeas D, Blanca J, Aranda MA, Arus P, Nuez F, Monforte AJ, Pico MB, Garcia-Mas J (2009)
    A set of EST-SNPs for map saturation and cultivar identification in melon
    BMC Plant Biology 9
  • Gisbert AD, Lopez-Capuz I, Soriano JM, Llácer G, Romero C, Badenes ML (2009)
    Development of microsatellite markers from loquat (Eriobotrya japonica (Thunb.) Lindl.)
    Molecular Ecology Resources 9: 803-805
  • • Gisbert AD, Martínez-Calvo J, Llácer G, Badenes ML, Romero C (2009)
    Development of two loquat (Eriobotrya japonica (Thunb.) Lindl.) linkage maps based on AFLP and SSR markers from different Rosaceae species
    Molecular Breeding 23: 523-538
  • Obando-Ulloa JM, Jowkar MM, Moreno E, Souri MK, Martinez JA, Bueso MC, Monforte AJ, Fernandez-Trujillo JP (2009)
    Discrimination of climacteric and non-climacteric melon fruit at harvest or at the senescence stage by quality traits
    Journal of the Science of Food and Agriculture 89, 1743-1753.
  • Essafi A, Diaz-Pendon JA, Moriones E, Monforte AJ, Garcia-Mas J, Martin-Hernandez AM (2009)
    Dissection of the oligogenic resistance to Cucumber mosaic virus in the melon accession
    Genetics 118, 275-284
  • Tzitzikas EN, Monforte AJ, Fatihi A, Kypriotakis Z, Iacovides TA, Ioannides IM, Kalaitzis P (2009)
    Genetic Diversity and Population Structure of Traditional Greek and Cypriot Melon Cultigens (Cucumis melo L.) Based on Simple Sequence Repeat Variability
    Hortscience 44, 1820-1824.
  • Gisbert AD, Romero C, Martínez-Calvo J, Leida C, Llácer G, Badenes ML (2009)
    Genetic diversity evaluation of a loquat (Eriobotrya japonica (Thunb) Lindl) germplasm collection by SSRs and S-allele fragments
    Euphytica 168: 121-134
  • Obando-Ulloa JM, Eduardo I, Monforte AJ, Fernandez-Trujillo JP (2009)
    Identification of QTLs related to sugar and organic acid composition in melon using near-isogenic lines
    Scientia Horticulturae 121, 425-433
  • • Fernandez-Silva I, Moreno E, Eduardo I, Arus P, Alvarez JM, Monforte AJ (2009)
    On the Genetic Control of Heterosis for Fruit Shape in Melon (Cucumis Melo L.).
    Journal of Heredity 100, 229-235
  • Tijskens LMM, Dos-Santos N, Jowkar MM, Obando-Ulloa JM, Moreno E, Schouten RE, Monforte AJ, Fernandez-Trujillo JP (2009)
    Postharvest firmness behaviour of near-isogenic lines of melon
    Postharvest Biology and Technology 51, 320-326
Entidad financiadora: 
EUROPEAN COMMISSION Horizon 2020 - Research and Innovation Framework Programme
IP: 
Antonio Granell
Entidad financiadora: 
MINECO
IP: 
Antonio J. Monforte
Entidad financiadora: 
EU (Plant-KBBE)
IP: 
Daniele Hosemans (Coordinador Internacional) . Antonio J Monforte (CSIC).
Entidad financiadora: 
Programa bilteral CSIC.
IP: 
Antonio J Monforte
Entidad financiadora: 
MCINN.
IP: 
Antonio J. Monforte
Entidad financiadora: 
FECYT
IP: 
Antonio J. Monforte y Antonio Granell
Entidad financiadora: 
MCINN
IP: 
Antonio Granell
Entidad financiadora: 
Semillas Arnerdo SA.
IP: 
Fernando Nuez
Entidad financiadora: 
Genoma España
IP: 
Pere Puigdomenech
Entidad financiadora: 
Inveseed S.L.U.
IP: 
Antonio Monforte
Entidad financiadora: 
UPV
IP: 
Maria José Díez
Entidad financiadora: 
Universidad Politécnica de Valencia
IP: 
Belén Picó
Entidad financiadora: 
European Commission. SFS-05-2015: Strategies for crop productivity, stability and quality
IP: 
Monder Bouzayen
Entidad financiadora: 
MINECO
IP: 
Antonio J. Monforte Gilabert. y Carlos Romero Salvador
Genómica en Mejora Vegetal