Grupos de investigación

Grupo: Genómica en Mejora Vegetal

Genómica en Mejora Vegetal

Origen y Antecedentes

El grupo de Genómica en Mejora Vegetal se fundó en 2008 con la incorporación de Antonio J. Monforte al IBMCP como Científico Titular CSIC, quien realizó previamente sus Tesis Doctoral en el IVIA, posteriormente una estancia postdoctoral en la Universidad de Cornell y fue investigador durante más de 8 años en el IRTA (ahora fusionado con el CRAG). Se inicia entonces una línea de trabajo sobre la aplicación de herramientas genómicas en mejora genética que no existía previamente en el IBMCP. Las primeras personas en trabajar en el grupo fueron los doctorandos Gerardo Sánchez y Walter Barrantes, la investigadora postdoctoral Aurora Díaz y la técnico de laboratorio Soledad Casal que asientan la línea de investigación. En 2014 se incorpora Carlos Romero como Científico Titular CSIC. Carlos había realizado su Tesis Doctoral en el IBMCP, integrándose posteriormente en el Dpto. de investigación de la empresa de semillas Rijk Zwaan S. A. y más tarde en el IVIA donde fue investigador durante más de 12 años. El grupo se encuentra actualmente consolidado con las incorporaciones de las investigadoras posdoctorales Clara Pons y Maria José Gonzalo.

Líneas de Investigación

El principal objetivo es la aplicación de la genómica para la identificación implicados en caracteres de interés agronómico, fundamentalmente hortícolas. Nuestro cuerpo teórico se entronca en la genética de poblaciones, genética cuantitativa, evolución y teoría de la mejora que integramos con la agronomía, biología molecular y genómica. Generamos conocimiento y herramientas útiles para el desarrollo de nuevos cultivares que respondan a las necesidades actuales del sector, así como básico para comprender mejor las bases genéticas y moleculares, de la variación fenotípica. Tenemos un especial interés es descubrir variabilidad genética "oculta" en especies silvestres para mejorar productividad, resistencia a enfermedades y estreses abióticos, calidad nutricional, comportamiento poscosecha.

Las herramientas básicas que utilizamos son los marcadores moleculares, empezamos con RFLPs, seguimos con SSRs, SNPs y actualmente genotipado de alto rendimiento y secuenciación masiva. Nuestras estrategias incluyen el desarrollo de mapas genéticos, análisis de QTLs y desarrollo de líneas de introgresión o QTL-NILs.

Concretamente las líneas de investigación en la que estamos trabajando son:

- Bases genéticas de la morfología del fruto en melón

- Control genético de la domesticación en melón

- Barreras reproductivas interespecíficas en el género Cucumis

- Sistema de autoincompatibilidad gametofítica en Prunus

- Caracterización y valorización de las variedades de tomate tradicionales europeas (TRADITOM)

- Tolerancia a altas temperaturas en tomate (TOMGEN)

Bibliografía destacada

DIAZ, A., FERGANY, M., FORMISANO, G., ZIARSOLO, P., BLANCA, J., FEI, Z.J., STAUB, J.E., ZALAPA, J.E., CUEVAS, H.E., DACE, G., OLIVER, M., BOISSOT, N., DOGIMONT, C., PITRAT, M., HOFSTEDE, R., VAN KOERT, P., HAREL-BEJA, R., TZURI, G., PORTNOY, V., COHEN, S., SCHAFFER, A., KATZIR, N., XU, Y., ZHANG, H.Y., FUKINO, N., MATSUMOTO, S., GARCIA-MAS, J., & MONFORTE, A.J. (2011). A consensus linkage map for molecular markers and Quantitative Trait Loci associated with economically important traits in melon (Cucumis melo L.). BMC Plant Biology 11.

MONFORTE, A.J., DIAZ, A., CANO-DELGADO, A., & VAN DER KNAAP, E. (2014) The genetic basis of fruit morphology in horticultural crops: lessons from tomato and melon. Journal of Experimental Botany 65:4625-4637.

TIEMAN, D., ZHU, G.T., RESENDE, M.F.R., LIN, T., TAYLOR, M., ZHANG, B., IKEDA, H., LIU, Z.Y., FISHER, J., ZEMACH, I., MONFORTE, A., ZAMIR, D., GRANELL, A., KIRST, M., HUANG, S., KLEE, H., NGUYEN, C., BIES, D., RAMBLA, J.L., & BELTRAN, K.S.O. (2017) A chemical genetic roadmap to improved tomato flavor. Science 355:391-394.

ZURIAGA E, MOLINA L, BADENES ML & ROMERO C (2012) Physical mapping of a pollen modifier locus controlling self-incompatibility in apricot and synteny analysis within the Rosaceae. Plant Molecular Biology 79:229–242.

ZURIAGA E, MUÑOZ-SANZ JV, MOLINA L, GISBERT AD, BADENES ML & ROMERO C (2013) An S-locus independent pollen factor confers self-compatibility in “Katy” apricot. PLoS One 8:e53947.

MUÑOZ-SANZ JV, ZURIAGA E, LÓPEZ I, BADENES ML & ROMERO C (2017) Self-(in)compatibility in apricot germplasm is controlled by two major loci, S and M. BMC Plant Biology 17: 82.

Genómica en Mejora Vegetal

Investigadores

Personal Contratado y Becarios

Visitantes

Cristina Esteras. Estera Gómez, Profesora Ayudante Doctor. UPV. Equipo investigación proyectos cucurbitáceas María Ferriol Molina, Profesora Titular Universidad. UPV. Equipo investigación proyectos cucurbitáceas. Pablo Sipowicz. Tesis Fin de Máster Gonçalo da Silva. Tesis Fin de Máster
  • Muñoz-sanz JV, Zuriaga E, López I, Badenes ML, Romero C (2017)
    Self-(in)compatibility in apricot germplasm is controlled by two major loci, S and M
    BMC Plant Biology 17(1): 1
  • Fernandez-Moreno JP, Levy-Samoha D, Malitsky S, Monforte AJ, Orzaez D, Aharoni A, Granell A (2017)
    Uncovering tomato quantitative trait loci and candidate genes for fruit cuticular lipid composition using the Solanum pennellii introgression line population
    Journal of Experimental Botany 68, 2703-2716
  • Gascuel Q, Diretto G, Monforte AJ, Fortes AM, Granell A (2017)
    Use of Natural Diversity and Biotechnology to Increase the Quality and Nutritio nal Content of Tomato and Grape
    Frontiers in Plant Science 8
  • Perpina G, Esteras C, Gibon Y, Monforte AJ, Pico B (2016)
    A new genomic library of melon introgression lines in a cantaloupe genetic background for dissecting desirable agronomical traits
    BMC Plant Biology 146: 154
  • Barrantes W, Lopez-Casado G, Garcia-Martinez S, Alonso A, Rubio F, Ruiz JJ, Fernandez-Munoz R, Granell A, Monforte AJ (2016)
    Exploring New Alleles Involved in Tomato Fruit Quality in an Introgression Line Library of Solanum pimpinellifolium
    Frontiers in Plant Science 7
  • Zeballos JL, Abidi W, Giménez R, Monforte AJ, Moreno MÁ, Gogorcena Y (2016)
    Mapping QTLs associated with fruit quality traits in peach [Prunus persica (L.) Batsch] using SNP maps

    Tree Genetics and Genomes 12: 37

  • Diaz A, Forment J, Argyris JM, Fukino N, Tzuri G, Harel-Beja R, Katzir N, Garcia-Mas J, Monforte AJ (2015)
    Anchoring the consensus ICuGI genetic map to the melon (Cucumis melo L.) genome

    Molecular Breeding 35: 188

  • Leida C, Moser C, Esteras C, Sulpice R , Lunn JE, de LangenF, Monforte AJ, Picó B (2015)
    Variability of candidate genes, genetic structure and association with sugar accumulation and climacteric behavior in a broad germplasm collection of melon (Cucumis melo L.)

    BMC Genetics 16: 28

  • Malik AA, Vashisht VK, Singh K, Sharma A, Singh DK, Singh H, Monforte AJ, McCreight JD, Dhillon NPS (2014)
    Diversity among melon (Cucumis melo L.) landraces from the Indo-Gangetic plains of India and their genetic relationship with USA melon cultivars

    Genetic Resources and Crop Evolution 61: 1189-1208

  • Yahia Y, Hannachi H, Monforte AJ, Cockram J, Loumerem M, Zarouri B, Ferchichi A (2014)
    Genetic diversity in Vicia faba L. populations cultivated in Tunisia revealed by simple sequence repeat analysis

    Plant Genetic Resources: Characterization and Utilization 12: 278-285

Entidad financiadora: 
EUROPEAN COMMISSION Horizon 2020 - Research and Innovation Framework Programme
IP: 
Antonio Granell
Entidad financiadora: 
MINECO
IP: 
Antonio J. Monforte
Entidad financiadora: 
EU (Plant-KBBE)
IP: 
Daniele Hosemans (Coordinador Internacional) . Antonio J Monforte (CSIC).
Entidad financiadora: 
Programa bilteral CSIC.
IP: 
Antonio J Monforte
Entidad financiadora: 
MCINN.
IP: 
Antonio J. Monforte
Entidad financiadora: 
FECYT
IP: 
Antonio J. Monforte y Antonio Granell
Entidad financiadora: 
MCINN
IP: 
Antonio Granell
Entidad financiadora: 
Semillas Arnerdo SA.
IP: 
Fernando Nuez
Entidad financiadora: 
Genoma España
IP: 
Pere Puigdomenech
Entidad financiadora: 
Inveseed S.L.U.
IP: 
Antonio Monforte
Entidad financiadora: 
UPV
IP: 
Maria José Díez
Entidad financiadora: 
Universidad Politécnica de Valencia
IP: 
Belén Picó
Entidad financiadora: 
European Commission. SFS-05-2015: Strategies for crop productivity, stability and quality
IP: 
Monder Bouzayen
Entidad financiadora: 
MINECO
IP: 
Antonio J. Monforte Gilabert. y Carlos Romero Salvador
Genómica en Mejora Vegetal